El presidente de la Autoridad Portuaria Bahía de Cádiz (APBC), José Luis Blanco, ha reconocido que, a medio plazo, traslasará la actividad de la lonja de Cádiz a las instalaciones de El Puerto de Santa María. Para ello la APBC ha puesto en marcha una política de no asumir compromisos a largo plazo con las empresas que operan en la actualidad en las instlaciones gaditanas.
El planteamiento de la APBC sería no gestionar directamente las instalaciones de la lonja portuense, siendo un concesionario privado el que se haría cargo de la gestión.